早在 2006 年北京协和医院在国内率先设立痛风专科门诊，曾学军教授曾先后组织并参与多个降尿酸的上市前后研究。课题组是国内蕞早开展规范化关节穿刺核实临床诊断痛风的团队，多次获得行业基金等项目支持开展高尿酸血症和痛风的相关研究，开展流行病学、医生诊疗行为医学、疾病治 疗规范制订与推广、以及卫生经济学等研究。
曾学军教授在多项首发基金连续十年支持下开展大型综合医院与社区医疗机构合作模式的研究。2005年始主持《社区中老年人健康管理规范》的制订和推广，成为国家公共卫生规范项目之一，并于2015年成为国家推荐标准。
曾学军教授参与了国内目前所有关于痛风和高尿酸血症指南的制定工作， 2013 年牵头制定了《高尿酸血症社区管理规范草案》，2018年11月在中华全科医师杂志上发表修订版《高尿酸血症社区管理流程的专家建议》，2020年4月再次牵头制定《痛风及高尿酸血症基层诊疗指南》。
2020年8月，北京协和医院风湿免疫科实验室完成了靶抗原特异性标志物的全部项目方法学升级，由传统手工、批量操作、定性检测的酶联免疫吸附测定（ELISA）升级为全自动、实时进样、高通量、定时检测的化学发光检测方法，可检测自身抗体60余种。这也是国内三甲医院第 一条专门用于自身抗体检测的全自动流水线，日运行通量可达1.5万次。报告时间缩短到0.5至1个工作日，为患者的精 准诊断提供了重要支撑。