先后承担2项国家自然科学基金重点项目，国家“863”计划、国家“973”计划课题组长、重大新药创制等课题多项；获国家发明专利授权4项，国际专利（德国、美国）授权2项，申请国家发明专利3项；发表SCI论文34篇，或通讯作者29篇，影响因子146.837；主编专著四部；先后获国家科技进步二等奖2项、省部级科技一等奖3项，二等奖1项。
长期从事风湿临床免疫基础和临床研究。首次发现：新生抗原介导了强直性脊柱炎发病，是该领域里程碑式重大发现（Science，2023）；类风湿关节炎滑膜中铁死亡机制；CD147是病毒和疟原虫入侵人体新受体。研发成功抗恶性疟疾和重症新冠病毒感染特异创新；建立了炎性关节炎内外科综合诊疗关键技术体系，首先提出“AS合并髋关节炎MRI评估标准”，主持建立《ANCA检测技术》和《中轴型脊柱关节炎综合评估》中国专家共识。
1993年12月，时任传染科副主任医师、副教授的朱平已在传染病领域积累了丰富的临床经验，关于流行性出血热发病机制的研究项目获得军队科技进步二等奖，但她毅然服从医院发展需要的安排，调任至彼时“一穷二白”的免疫科，从头做起。
多年来，朱平始终把敬佑生命、救死扶伤作为行医使命。她坚持运用前沿创新理论指导临床，不断提升急危重症及疑难杂症患者救治率；她待患若亲，以仁爱之心服务每一位患者。