黄晓军教授长期聚焦白血病等其他恶性血液疾病的前沿研究和临床，创建骨髓移植中国科学新方案—“北京方案”，解决了“供者来源匮乏”这一世界性医学难题，使亲属成为移植供者的概率由不足25%上升至接近；显著提高了患者生存，使半相合移植白血病的3年生存率从约20%升至70%左右。北京方案改变了世界半相合移植“不可逾越”的传统观念，使半相合移植成为白血病一线方案，促进了全球白血病和骨髓移植学科的在近20年的长足进步。
黄晓军教授主持国家863计划、国家杰出青年基金、国家自然基金重点项目等国家项目，在白血病等恶性血液病的、诊断等方面进行了系统性和开创性工作，以或通讯作者身份在新英格兰医学杂志（New Eng J Med，2篇）、临床肿瘤学（J Clin Oncol，1篇）、血液学（Blood，6篇）、白血病（Leukemia，5篇）等国际期刊发表SCI论文190篇，主编专著20部。牵头制定多项中国及亚太血液病指南/标准并推广普及，主持我国高水平多中心临床研究，领导建设中国造血干细胞移植登记数据库、慢性髓性白血病联盟，促进我国血液病诊治的规范化及人才建设。
黄晓军医生擅长
血液系统疾病，造血干细胞移植（HSCT）后的移植物抗宿主病（GVHD）、感染和复发等各种移植合并症的诊断和处理
黄晓军，男，1964年生，汉族，江西省南丰县人，北京大学人民医院血液病研究所所长，主任医师、教授。
1987年毕业于中山医科大学医疗系。
1992年于北京医科大学获医学博士学位。
1997年-1998年在美国Einstein医学院肿瘤研究中心从事血液恶性肿瘤新的研究。
1989年开始从事血液病临床及实验研究，对造血干细胞移植技术及其各种合并症、各种急慢性白血病的诊断有丰富的临床经验。率先探索并完成了人类白细胞抗原(HLA)不合/单倍体HSCT(hematopoieticstem cell transplantation)的临床和实验研究;在国内早成功开展了非血缘HSCT，创立并完善了非血缘HSCT的技术体系;领导了非清髓HSCT的临床工作;对HSCT后复发白血病的传统技术进行了改造。
是个感染指南的执笔者及制定者之一。